451 papers
Deze studie gebruikt transcriptomische analyses van 98 spinnensoorten om te bepalen of het spinnen van orb-webben het resultaat is van convergente evolutie of van een gemeenschappelijke voorouder, door te zoeken naar genetische tekenen van selectie en genverlies.
Dit onderzoek toont aan dat voortplantingssystemen met partnerkeuze de overlevingskansen van populaties onder omgevingsverandering tweeledig beïnvloeden: ze vergroten het risico op uitsterven bij kleine populaties door sneller verlies van genetische diversiteit, maar bevorderen bij grote populaties de evolutionaire redding door adaptatie te versnellen.
Dit paper presenteert een abstract model op basis van een multivariate schattingsverdelingsalgoritme dat de interactie-based evolutie-theorie ondersteunt door te tonen dat mutaties niet-random en niet-Lamarckiaans zijn, maar worden beïnvloed door interne informatie-integratie in het genoom over generaties heen.
Dit onderzoek identificeert een evolutionair geconserveerd cluster van enhancers dat de expressie van efnb2 in de dorsale retina van gewervelden reguleert en een link legt tussen deze cis-regulerende architectuur en variatie in menselijke oogdikte.
Dit onderzoek toont aan dat de facultatieve parthenogenetische phasmide *Megacrania batesii* een opmerkelijke variatie vertoont in de mechanismen van parthenogenese, zowel tussen lijnen als binnen individuen, wat leidt tot aanzienlijke verschillen in het behoud van heterozygotie en genetische diversiteit en zo de langetermijnpersistentie van parthenogenetische lijnen kan beïnvloeden.
Deze studie beschrijft voor het eerst het bestaan van een persistent en veelvoorkomend 'Mega-NUMT' in de neotropische fruitvlieg *Drosophila paulistorum*, waarbij tot 60 volledige mitochondriale genoomkopieën in één chromosoomcluster zijn geïntegreerd en waarschijnlijk door balancerende selectie in de natuur worden gehandhaafd.
Deze studie biedt een single-cell sequentie-analyse van de volledige levenscyclus van *Oikopleura dioica*, waardoor inzicht wordt verkregen in de celtype-diversiteit en de genexpressie van het epitheel dat verantwoordelijk is voor de aanmaak van het filtervoedingshuis.
Dit onderzoek gebruikt genomics van herbariumspecimens om de oorsprong in Japan en de wereldwijde verspreiding van de invasieve Japanse duizendknoop te reconstrueren, waarbij wordt aangetoond dat de geïntroduceerde populaties genetisch uniform zijn gebleven door vegetatieve voortplanting en dat hybriden voornamelijk na de introductie in Europa en Noord-Amerika zijn ontstaan.
Onderzoek met Drosophila melanogaster toont aan dat compatibiliteit tussen mitochondriale en nucleaire genen de productie van mannelijke cuticulaire koolwaterstoffen beïnvloedt, wat direct leidt tot een hoger paringssucces wanneer deze genen gecoördineerd zijn.
Dit onderzoek toont aan dat bij de zeeanemoon *Haliclystus sanjuanensis* de regressie van juveniele tentakels wordt gedreven door het verlies van celdeling, terwijl nieuwe volwassen structuren ontstaan door hergebruik van het tentakelontwikkelingsprogramma en een verschuiving in celproliferatie, wat een mechanisme illustreert voor het diversifiëren van volwassen lichaamsplannen zonder volledige metamorfose.
Dit onderzoek onthult dat de Y-chromosomen van *Mercurialis annua* twee evolutionaire lagen vertonen die zijn ontstaan door opeenvolgende onderdrukking van recombinatie, en identificeert het gen APRR7 als een sterke kandidaat voor de master-seksbepaling binnen het geslacht.
Uit deze studie blijkt dat structurele selectie alleen binnen meso-structurele domeinen waarneembaar is, waardoor evolutionaire gradiënten zichtbaar worden die in geaggregeerde netwerken verdwijnen.
Dit onderzoek identificeert de bacteriële transporteiwitten CysZ en YihY als de evolutionaire voorouders van de mitochondriale ATP-exporteur, waardoor de langdurige vraag naar de bacteriële oorsprong van dit cruciale eukaryotische kenmerk wordt opgelost.
Deze studie toont aan dat eenzijdige kruisvoeding de adaptieve evolutie van zowel de producerende als de consumerende bacteriesoort beperkt door sterkere zuiverende selectie en een verhoogde afhankelijkheid, zelfs wanneer de fitnessvoordelen niet wederzijds zijn.
Dit artikel introduceert een nieuwe Bayesiaanse maatstaf voor de fylogenetische informatiewaarde, gebaseerd op geodetische afstanden in boomruimte en de relatieve variantie tussen prior- en postverdelingen, die toepasbaar is op zowel gesimuleerde als empirische data om ook informatieconflict tussen datasets te kwantificeren.
Deze studie toont aan dat fotosynthetische algen in de ciliaat *Paramecium bursaria* fungeren als cruciale organisatoren van de dagelijkse genexpressie van de gastheer, waarbij ze een uitgebreid ritmisch transcriptoom aansturen dat afhankelijk is van fotosynthese en ook voorkomt bij andere symbiotische protisten.
Dit onderzoek toont aan dat de wereldwijde invasies van ambrosiakevers worden gestructureerd door een combinatie van inteelt, die schadelijke mutaties kan ophopen, en hybridering tussen lijnen, wat de reiniging van deze genetische last mogelijk maakt en een aanzienlijke bioveiligheidsdreiging vormt.
Dit onderzoek onthult dat geografische variatie in de maan-gecoördineerde paaitijd van de graspuer (Takifugu alboplumbeus) langs de Japanse kust wordt veroorzaakt door verschillen in het circadiane ritme, die worden gekoppeld aan specifieke genetische varianten in het gen *prrt1l*.
Deze studie toont aan dat *Fasciola hepatica*-populaties in het VK, die runderen en schapen infecteren, een beperkte genetische structuur vertonen en een hoge genstroom ervaren, wat wordt ondersteund door de identificatie van voornamelijk gedeelde ampliconsequentievarianten in mitochondriale genen.
Dit onderzoek toont aan dat bacteriële genregulatie via exaptatie kan evolueren doordat gladde adaptieve landschappen het mogelijk maken om nieuwe transcriptiefactorbindingsplaatsen te vormen via kleine, adaptieve mutaties, waarbij transcriptiekruisverontreiniging een cruciale rol speelt in de diversificatie.